Molecular methods for the diagnosis of acute viral gastroenteritis

Milagrosa Montes*, Miren Iturriza-Go'Mara

*Corresponding author for this work

Research output: Contribution to journalArticlepeer-review

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Abstract

Acute gastroenteritis (AGE) is a major cause of morbidity and mortality worldwide. In Europe, viruses are responsible for most episodes of gastroenteritis, and among these, rotaviruses are associated with most AGE in children under the age of 2 years, and noroviruses in older ages. Classical methods for laboratory diagnosis leave between 60 and 70% of cases undiagnosed. Most cases in which the etiology is unknown are probably caused by viruses. Through the use of molecular methods (nucleic acid amplification) with greatly improved sensitivity and specificity, this diagnostic gap in AGE can be greatly reduced. Molecular methods are particularly advantageous in the detection of viruses, and in particular, in that of noroviruses and rotaviruses. The high incidence and transmissibility of noroviruses has a major impact on public health, and noroviruses are the major cause of outbreaks of AGE worldwide. Rotaviruses are the major cause of severe acute infantile AGE throughout the world. As well as serving as tools for diagnosis, molecular methods are essential for the genetic characterization of co-circulating strains. Through the use of molecular methods, the true incidence of viral AGE can be more accurately established, and the role of novel viruses in this highly common syndrome can be assessed.

Translated title of the contributionMolecular methods for the diagnosis of acute viral gastroenteritis
Original languageSpanish
Pages (from-to)81-85
Number of pages5
JournalEnfermedades Infecciosas y Microbiologia Clinica
Volume26
Issue numberSUPPL. 9
DOIs
Publication statusPublished - Jul 2008

Bibliographical note

Funding Information:
Las técnicas moleculares han puesto de relieve el des-tacado papel de norovirus en la producción de brotes, epi-demias y casos esporádicos de GEA. Hay métodos de EIA comercialmente disponibles para su detección, pero tie-nen menor sensibilidad y especificidad que los molecula-res, considerados de elección. El mayor problema que presentan los EIA es que son genotipo específicos y sólo detectan cepas genéticamente similares a las empleadas en el diseño del equipo. Varios estudios han analizado di-ferentes EIA para detectar norovirus, cuya sensibilidad oscila entre el 30 y el 70%, y su especificidad, entre el 70 y el 100%, en función de los equipos empleados y en la zona geográfica en la que se hizo el estudio11,12. Así, en el es-tudio multicéntrico europeo dirigido por Gray et al13, en el que se compararon 2 EIA para detectar antígeno de no-rovirus en muestras fecales con la RT-PCR, se recomen-dó la confirmación mediante métodos moleculares de los casos detectados por EIA. Numerosos trabajos han con-firmado que los métodos moleculares para detectar noro-virus son más sensibles que la detección de antígeno me-diante EIA13,14. Nuevos refinamientos de las técnicas de amplificación, como es la PCR en tiempo real, pueden in-crementar más la sensibilidad de los métodos molecula-res15. En conclusión, los métodos moleculares constituyen la mejor elección para el diagnóstico de norovirus en los laboratorios de microbiología, y el EIA se limita a labora-torios que carezcan de técnicas moleculares y para situa-ciones concretas, como el diagnóstico de grandes brotes, debido a que, aunque la sensibilidad no sea muy alta, al procesar un número elevado de muestras se puede llegar al diagnóstico etiológico del brote. En la actualidad, están comenzando a comercializarse métodos moleculares, al-gunos con marcado CE, si bien carecemos aún de infor-mación suficiente sobre su comportamiento.

Keywords

  • Acute gastroenteritis
  • Infectious diarrhoea
  • Molecular biology
  • Norovirus
  • Rotavirus
  • Virus

Fingerprint

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